الهدف من برنامج الماجستير في الهندسة الطبية هو تأهيل الطلاب بالتغطية الشاملة للمواد النظرية في مجال الالكترونيات والفيزياء الطبية والتطبيقات العملية على الأجهزة المستخدمة في مراحل الطب الثلاث (كشف- تشخيص – علاج ).

الأهداف العامة:

* أعداد كوادر مؤهلة تأهيلا عالياً في مجال الهندسة الطبية نظرياً و تطبيقياً.

الأهداف الخاصة:

* أعداد كوادر في مجال الهندسة الطبية وتزويدهم بالمستوى المطلوب فى المعرفة المتقدمة والتطورات الحديثة.

* اكتساب خبرة عملية تطبيقية في مجال الهندسة الطبية.

* ترقية الأبحاث العلمية في مجال الهندسة الطبية من اجل التطوير وضبط الجودة.